倒置熒光顯微鏡由熒光附件與倒置顯微鏡有機結合構成的，是為了適應生物學、醫學等領域中的組織培養、細胞離體培養、浮游生物、環境保護、食品檢驗等顯微觀察。儀器配有長工作距離平場消色差物鏡、大視野目鏡、雙目觀察、超長工作距離聚光鏡、襯裝置及長工作距離平場相襯物鏡。 是生物學，細胞學，腫瘤學，遺傳學，免疫學等研究工作的理想儀器。可供科研、高校、醫療、防疫和農牧等部門使用。

倒置熒光顯微鏡是近代發展起來的新式熒光顯微鏡，激發光從物鏡向下落射到標本表面，用同一物鏡作為照明聚光器和收集熒光的物鏡。光路中需加上一個雙色束分離器，它與光鈾呈45度角，激發光被反射到物鏡中，并聚集在樣品上，所產生的熒光、物鏡透鏡表面、蓋玻片表面反射的激發光同時進入物鏡，反回到雙色束分離器，使激發光和熒光分開，殘余激發光再被阻斷濾片吸收。

倒置顯微鏡多用于無色透明的活體觀察，在倒置顯微鏡的基礎上添加一套熒光附件：激光激發塊，熒光光源，熒光照明器，激發塊切換裝置，即可進行倒置熒光觀察。進口顯微鏡都有相應的倒置熒光顯微鏡，如奧林巴斯的IX71倒置熒光顯微鏡，CKX41倒置熒光顯微鏡。