小型垂直电泳有四部分组成：电泳槽外壳、相对应的模块、缓冲液槽和盖；玻璃板和梳子；加样引导器；制胶支架和制胶框。该系统设计大特点是功能灵活，即可以做普通的蛋白电泳，又可以做电洗脱和双向凝胶电泳。另外制胶简便，大大节约了整个电泳的时间。